Yuuki Yuuna wa Yuusha de Aru olayları sırasında kaderlerini yerine getiren Yuuna Yuuki, Karin Miyoshi ve kardeşler Fuu ve Itsuki Inubouzaki'den oluşan Sanshu Ortaokulu Kahraman Kulübü, tüm hızıyla geri döndüler. Sonoko Nogi adında geçmişte kahraman olan yeni bir üye alırlar. Aralarında olması gereken Mimori Tougou'nın kayıp olduğuun farkeden klüp Kızların anıları dışında varlığının ortadan kalktığını farkederler. Tougounun nerede olduğuna dair hiç bir ipucu bulamayan kızlar, kayıp arkadaşlarını umutuszca aramaya başlarlar.Ancak buldukları şey, herhangi birinin hayal edebileceğinden daha şok edicidir.