Gakusen Toshi Asterisk'in 2. Sezonu, Irene ve Priscilla Urzaiz kız kardeşler ile uzun ve yorucu bir savaşın ardından Phoenix Festa'nın bir sonraki turuna devam eden Genestella öğrencileri Ayato Amagiri ve Julis-Alexia von Riessfeld'in hikayesini takip etmektedir. Julis ve Ayato'nun saklama çalışmalarına rağmen, Ayato'nun güçlerinin mühürlendiği gerçeği artık bir sır değil. Şimdi büyük bir dezavantajda, ikili Phoenix Festa'yı kazanma umuduyla bir plan yapmalı. Kesin olan tek bir şey var: yoluna çıkan sorunlar bundan sonra dahada zorlaşacak..