Herhangi bir dileği yerine getirme vaadi ile, her yerde yetişen Kutsal Kase, geçmişte her biri bir zafer bırakmayacak kadar acımasız ve sert olan üç savaşı tetikledi. Fate/Zero serisi Fuyuki şehrindeki dördüncü kutsal kase savaşını konu alıyor.

Savaştan galip çıkmak için tekrar üç kurucu ailenin liderleri bir araya gelmişlerdir. Einzbern’ler normalde önceki ksae savaşlarına homunkuluslar(yapay insanlar) ile katılmışlardır. Bu sefer Irisviel adında bir homunkulusun yanısırsa Hizmetkarların efendisi olmak için tetikçi olan Emiya Kiritsugu’yu kiralarlar. Bu savaşın namını yurtdışından duyan Magus Birliği üyesi Kayneth El-Meloi ve henüz bir öğrenci olan genç Waver Velvet de savaşa dahil olmak ister. Waver, Kayneth’in hizmetkarını çağırmak için gerekli olan eşyasın çalıp kendisi rider (binici) tipi savaşçı Büyük İskender’i çağırırken Kayneth elindeki ikinci bir eşya ile lancer (süvari) tipi savaşçı Diarmuid Ua Duibhne’yı çağırır.