Sirens adı verilen üstün teknolojiye sahip bir uzaylı gücü aniden ortaya çıkmıştır. Mezheplere bölünmüş olan insanlık bir dayanışma içine girdi. Kartal birliği, Kraliyet Donanması, Sakura imparatorluğu ve Demir Kanı olmak üzere dört ülke, açılan bu büyük tehditle birlikte birleşerek Azur Lane i kurdu. Azur Lane ilk zaferini aldıktan sonra ittifak parçalandı. Sakura imparatorluğu ve Demir kan ayrılarak Kırmızı eksenini oluşturdu. İnsanlık bir kezz daha parçalandı.

Azur Lane in savaşı sonlardırma umudunu taşıyan tecrübeli ve deneyimli bir savaşçı olan "Grey Ghost" okyanustan korkan zayıf bir kızı koruma altına almıştır. Varlığının tek amacı savaşmak olduğuna inandığından savaşmaya devam eder.